實驗室超聲波細胞破碎儀的原理并不是太神秘、太復雜。簡單說就是將電能通過換能器轉換為聲能，這種能量通過液體介質而變成一個個密集的小氣泡，這些小氣泡迅速炸裂，產生的象小炸蛋一樣的能量，從而起到破碎細胞等物質的作用。
超聲波是物質介質中的一種彈性機械波，它是一種波動形式，因此它可以用于探測人體的生理及病理信息，既診斷超聲。同時，它又是一種能量形式，當達到一定劑量的超聲在生物體內傳播時，通過它們之間的相互作用,能引起生物體的功能和結構發生變化，即超聲生物效應。
超聲對細胞的作用主要有熱效應，空化效應和機械效應。熱效應是當超聲在介質中傳播時，摩擦力阻礙了由超聲引起的分子震動，使部分能量轉化為局部高熱（42-43℃），因為正常組織的臨界致死溫度為45.7℃，而腫liu組織比正常組織敏感性高，故在此溫度下腫liu細胞的代謝發生障礙，DNA、RNA、蛋白質合成受到影響，從而殺傷癌細胞而正常組織不受影響。
空化效應是在超聲照射下，生物體內形成空泡，隨著空泡震動和其猛烈的聚爆而產生出機械剪切壓力和動蕩，使腫liu出血、組織瓦解以致壞死。
另外，空化泡破裂時產生瞬時高溫（約5000℃）、高壓（可達500×104Pa），可使水蒸氣熱解離產生.OH自由基和.H原子，由.OH自由基和.H原子引起的氧化還原反應可導致多聚物降解、酶失活、脂質過氧化和細胞殺傷。
實驗室超聲波細胞破碎儀能實現提取、粉碎、乳化、勻化、懸浮液、變異、氣懸體、加速脫溶、晶化及在電子顯微鏡下配制各種生物樣本之多種功能。
實驗室超聲波細胞破碎儀注意：
1、切記空超。這一點很重要，有這樣一個案例，在沒有將超聲波破碎儀的變幅桿插入樣品中就開始開機空超，空超幾秒后，之后超聲波破碎儀在以后的使用過程中噪音變大。切記對超聲波破碎儀空超，空超的時間越長，對儀器的傷害越大。
2、超聲波破碎儀的變幅桿（超聲探頭）入水深度：1.5Cm左右，液面高度最好有30mm以上，探頭要居中，不要貼壁。超聲波是垂直縱波，插入太深不容易形成對流，影響破碎效率。
3、超聲波破碎參數設備：這一點請一定要參照使用說明書，設置鍵好儀器工作參數，主要是時間的參數，超聲功率的參數，還有容器的選擇。
時間要求：超聲時間每次時間不能過久，最好不要超過5秒，間隙時間應大于或等于超聲時間，這樣對熱量散發是有好處的。功率要求：不宜太大，太大會使樣品飛濺或起泡沫。容器選擇：有多少的樣品就選多大的燒杯，這樣也是有利樣品在超聲中對流，提高破碎效率。
4、日常保養中，用完后用酒精擦洗探頭或用清水進行超聲。
